Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Psma8Q9CWH6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psma8Q9CWH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psma8Q9CWH6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms