Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINDY3Q9CV28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MINDY3Q9CV28 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MINDY3Q9CV28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms