Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Q9CRW3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Q9CRW3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Q9CRW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRW3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRW3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Q9CRW3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9CRW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms