Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NenfQ9CQ45 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NenfQ9CQ45 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NenfQ9CQ45 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NenfQ9CQ45 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms