Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Commd4Q9CQ02 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Commd4Q9CQ02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Commd4Q9CQ02 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms