Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q99KU6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q99KU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99KU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99KU6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99KU6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99KU6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q99KU6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q99KU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q99KU6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q99KU6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q99KU6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q99KU6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q99KU6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q99KU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q99KU6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q99KU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Q99KU6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q99KU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q99KU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q99KU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q99KU6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q99KU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Q99KU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q99KU6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q99KU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q99KU6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q99KU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q99KU6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q99KU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q99KU6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99KU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99KU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q99KU6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q99KU6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms