Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pls3Q99K51 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pls3Q99K51 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pls3Q99K51 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms