Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Psmd6Q99JI4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmd6Q99JI4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd6Q99JI4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms