Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Csmd1Q923L3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Csmd1Q923L3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms