Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TardbpQ921F2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TardbpQ921F2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TardbpQ921F2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms