Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc5a4bQ91ZP4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Slc5a4bQ91ZP4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms