Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ1

Rab29, Ras-related protein Rab-7L1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab29Q91YQ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rab29Q91YQ1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rab29Q91YQ1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rab29Q91YQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms