Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ4

Pcdhb6, Protocadherin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb6Q91XZ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcdhb6Q91XZ4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb6Q91XZ4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcdhb6Q91XZ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb6Q91XZ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb6Q91XZ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb6Q91XZ4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb6Q91XZ4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb6Q91XZ4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb6Q91XZ4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms