Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Snrnp25Q8VIK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Snrnp25Q8VIK1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms