Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhdc3Q8VEM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhdc3Q8VEM9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhdc3Q8VEM9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms