Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr2bQ8CFI7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Polr2bQ8CFI7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Polr2bQ8CFI7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms