Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbxo43Q8CDI2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fbxo43Q8CDI2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fbxo43Q8CDI2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms