Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Krt222Q8CCX5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt222Q8CCX5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt222Q8CCX5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt222Q8CCX5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms