Protein–RNA interactions for Protein: Q8C779

Radx, RPA-related protein RADX, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RadxQ8C779 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RadxQ8C779 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RadxQ8C779 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RadxQ8C779 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RadxQ8C779 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms