Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp44Q8C2S0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp44Q8C2S0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp44Q8C2S0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp44Q8C2S0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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