Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT3

Gcfc2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcfc2Q8BKT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gcfc2Q8BKT3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gcfc2Q8BKT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gcfc2Q8BKT3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms