Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dupd1Q8BK84 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Dupd1Q8BK84 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Dupd1Q8BK84 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms