Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo28Q8BIG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo28Q8BIG4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo28Q8BIG4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo28Q8BIG4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo28Q8BIG4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Fbxo28Q8BIG4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbxo28Q8BIG4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbxo28Q8BIG4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms