Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW5

Whrn, Whirlin, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhrnQ80VW5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
WhrnQ80VW5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
WhrnQ80VW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WhrnQ80VW5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WhrnQ80VW5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms