Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Smap2Q7TN29 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Smap2Q7TN29 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smap2Q7TN29 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms