Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim12Q78RX3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smim12Q78RX3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smim12Q78RX3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms