Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU3

Mvb12a, Multivesicular body subunit 12A, mousemouse

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mvb12aQ78HU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mvb12aQ78HU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Mvb12aQ78HU3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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