Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cspg5Q71M36 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cspg5Q71M36 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cspg5Q71M36 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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