Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sned1Q70E20 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sned1Q70E20 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sned1Q70E20 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sned1Q70E20 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms