Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gja6Q6S5G4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gja6Q6S5G4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gja6Q6S5G4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gja6Q6S5G4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms