Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sort1Q6PHU5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sort1Q6PHU5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sort1Q6PHU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.6 ms