Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Snx13Q6PHS6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snx13Q6PHS6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx13Q6PHS6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx13Q6PHS6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms