Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rad54bQ6PFE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rad54bQ6PFE3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rad54bQ6PFE3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rad54bQ6PFE3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms