Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp49Q6P9L4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp49Q6P9L4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp49Q6P9L4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms