Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W2

Shkbp1, SH3KBP1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shkbp1Q6P7W2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Shkbp1Q6P7W2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shkbp1Q6P7W2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shkbp1Q6P7W2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Shkbp1Q6P7W2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shkbp1Q6P7W2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shkbp1Q6P7W2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shkbp1Q6P7W2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Shkbp1Q6P7W2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms