Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tvp23aQ6NVH0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tvp23aQ6NVH0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tvp23aQ6NVH0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms