Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg9bQ6EBV9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg9bQ6EBV9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atg9bQ6EBV9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atg9bQ6EBV9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms