Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nop58Q6DFW4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nop58Q6DFW4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nop58Q6DFW4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Nop58Q6DFW4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms