Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Fgd6Q69ZL1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fgd6Q69ZL1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Fgd6Q69ZL1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fgd6Q69ZL1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms