Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE9

Tshz2, Teashirt homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz2Q68FE9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tshz2Q68FE9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tshz2Q68FE9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tshz2Q68FE9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz2Q68FE9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz2Q68FE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz2Q68FE9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tshz2Q68FE9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.5 ms