Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CltcQ68FD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CltcQ68FD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CltcQ68FD5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
CltcQ68FD5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CltcQ68FD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms