Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cd33Q63994 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd33Q63994 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd33Q63994 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms