Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Six2Q62232 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Six2Q62232 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Six2Q62232 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Six2Q62232 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Six2Q62232 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six2Q62232 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six2Q62232 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms