Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EsrrbQ61539 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EsrrbQ61539 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EsrrbQ61539 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms