Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dsg1aQ61495 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dsg1aQ61495 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms