Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klf4Q60793 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klf4Q60793 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klf4Q60793 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms