Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctf1Q60753 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ctf1Q60753 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctf1Q60753 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms