Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf123Q5XPI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf123Q5XPI3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rnf123Q5XPI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Rnf123Q5XPI3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rnf123Q5XPI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rnf123Q5XPI3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf123Q5XPI3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms