Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc42Q5SV66 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc42Q5SV66 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc42Q5SV66 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc42Q5SV66 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms