Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQK8

4930512M02Rik, RIKEN cDNA 4930512M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930512M02RikQ5SQK8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930512M02RikQ5SQK8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
4930512M02RikQ5SQK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4930512M02RikQ5SQK8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms